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转基因玉米 NK603 质粒分子
Plasmid DNA Containing Genetically Modified NK603 Maize DNA Fragments
转基因玉米 NK603 质粒分子标准物质的研制可用于转基因玉米、食品和饲料等的定量检测、 安全评价和实验室质量控制和分析方法验证和评价等领域。
一、样品制备
本标准物质是将转基因玉米 NK603 转化体特异性序列和内标准基因片段共同构建于 pEASY-T3 载体,得到 pNIM-001 质粒分子,经提取,纯化和质量检测及均匀性初检合格后稀释 至(2.40×108)copy/μL 进行分装。
二、溯源性及定值方法
该标准物质 NK603 转化体特异性基因片段和内标准基因(zSSIIb)片段拷贝数比值特性量 值采用测序法和数码 PCR 法定值;转基因玉米 NK603 质粒分子标准物质浓度特性量值采用同位 素稀释质谱方法和数码 PCR 方法定值, 通过使用满足计量学特性要求的制备方法、测量方法和 计量器具,保证其量值溯源性。
三、特性量值及不确定度
1.NK603 转化体特异性基因片段和内标准基因(zSSIIb)片段拷贝数比值
编号 |
测序比值 |
扩展不确定度(k=2) |
PCR 比值 |
扩展不确定度(k=2) |
BW4015 |
1.00 |
0.04 |
0.97 |
0.09 |
2. 转基因玉米 NK603 质粒分子标准物质浓度
编号 |
标准值(copy/μL) |
扩展不确定度(k=2)(copy/μL |
BW4015 |
2.40×108 |
0.14×108 |
四、均匀性检验及稳定性考察
按照 JJF1343-2012《标准物质定值的通用原则及统计学原理》,根据统计学要求随机抽取样 品,采用实时荧光定量 PCR 方法对该标准物质进行瓶间均匀性检验和瓶内均匀性检验,最小取 样量为 5 μL,结果表明均匀性良好。
按照先密后疏的原则采实时荧光定量 PCR 方法对该标准物 质进行稳定性考察,标准值无方向性变化并通过平均值一致性检验,表明稳定性良好。
五、包装、储存及使用
1.包装与储存:本标准物质采用 2mL 立式拧口塑料离心管包装,每瓶 500μL/瓶;置于-70?C 冰箱中冷冻保存。
2.使用注意事项:使用前应先从冰箱内取出,待完全溶解后再打开瓶盖使用。样品开封后, 应尽快恢复密封状态。
3.使用建议:使用本标准物质制作标准曲线时,按照表 1 进行梯度稀释,然后再采用荧光定 量 PCR 进行检测,引物和探针序列[1, 2]详见表 2。
表 1 转基因玉米 NK603 质粒分子标准物质梯度稀释说明
初始浓度
(copy/μL) |
终浓度
(copy/μL) |
转化体特异性基因检测 a |
内标准基因
(zSSIIb)
检测 b |
DNA 缓冲液
(μL) |
质粒 DNA (μL) |
稀释倍数 |
2.4×108 |
4.8×106 |
|
|
490 |
10 |
50 |
4.8×106 |
2.4×105 |
|
E |
380 |
20 |
20 |
2.4×105 |
2.4×104 |
T |
E |
180 |
20 |
10 |
2.4×104 |
2.4×103 |
T |
E |
180 |
20 |
10 |
2.4×103 |
4.8×102 |
T |
|
200 |
50 |
5 |
4.8×102 |
2.4×102 |
T |
E |
100 |
100 |
2 |
2.4×102 |
48 |
T |
E |
80 |
20 |
5 |
a T 表示用于测定转化体特异性基因时所需的质粒分子标准物质的稀释浓度
b E 表示用于测定内标准基因基因时所需的质粒分子标准物质的稀释浓度
表 2 外源基因和内标准基因的引物及探针序列
基因名
称 |
引物或探针 |
序列信息 (5’-3’) |
扩增片段长度
/(碱基) |
外源基因 NK603 |
上游引物 |
ATGAATGACCTCGAGTAAGCTTGTTAA |
108 |
下游引物 |
AAGAGATAACAGGATCCACTCAAACACT |
||
探针 |
FAM-TGGTACCACGCGACAGACTTCCACTC-TAMRA |
||
内标准基因 zSSIIb |
上游引物 |
CTCCCAATCCTTTGACATCTGC |
151 |
下游引物 |
TCGATTTCTCTCTTGGTGACAGG |
||
探针 |
FAM-AGCAAAGTCAGAGCGCTGCAATGCA -TAMRA |
声明
1.本标准物质仅供实验室研究与分析测试工作使用,不能作为国家有证标准物质,开展法制计量相关工作。
2.因用户使用或储存不当所引起的投诉,不予承担责任。
3.收到后请立即核对品种、数量和包装,相关赔偿只限于标准物质本身,不涉及其他任何损失。
4.仅对加盖“中国计量科学研究院标准物质专用章”的完整证书负责。请妥善保管此证书。
5.如需获得更多与应用有关的信息,请与技术咨询部门联系。
注:以上信息仅供参考,以产品附带证书为准。
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